一个月内，同一个监管部门，却发出迥然不同的检测结论，引起舆论的不解和猜测。在此前的检测数据通报中，只是公布结果，并没有公布检验标准、检测数据等具体内容，令公众质疑两次检测的批号是否相同、检测标准是否统一。

　　有媒体报道甚至认为，此次某些企业从“不合格”摇身变“合格”的背后，是企业“公关”的结果。《经济参考报》在报道中称，“这一事件也受到检察机关的高度关注”，并称3月底以来已经有北京检察机关就相关问题涉及的渎职、行贿、寻租等问题向该报记者了解情况，并调取了相关证据材料。

       两次检测结果不一致，其核心问题也浮出水面：究竟螺旋藻类保健食品的铅是0.5mg/kg还是2.0mg/kg？

　　国家食品药品监管局方面称，2月29日通知所列不合格的13个产品是“监测发现的可疑产品”，其中9个产品来源于各地食品药品监管部门的监测结果，判断标准为铅指标2.0mg/kg，其他5个产品来源于媒体报道（含1个重复产品）。这一表述，回应了此前外界所指责的“两次检测标准不一致”问题。

       根据1997年原国家技术监督局颁布的《保健（功能）食品通用标准》，一般产品的铅指标为0.5mg/kg，一般胶囊产品为1.5mg/kg，以藻类为原料的固体饮料和胶囊产品铅指标为2.0mg/kg。

　　国家食品药品监管局解释称，由于该标准未明确以藻类为原料片剂产品的铅指标，且片剂产品的食用量与固体饮料相近，故以藻类为原料的片剂产品铅指标，以藻类为原料的固体饮料铅指标2.0mg/kg的标准执行。

　　2011年国家食品药品监管局就此类问题组织过相关专家进行讨论，“专家一致认为，以藻类为原料辅以其他少量辅料组方的产品（包括片剂），铅指标为2.0mg/kg是科学合理的”。

　　国家食品药品监管局强调，由于不同食品的每日食用量及其中铅的含量不同，螺旋藻保健食品与一般保健食品的铅不同。1997年颁布的《食用螺旋藻粉》（GB/T19619-1997）也规定，螺旋藻粉铅为2.0mg/kg。目前，欧盟食品补充剂的铅为3.0mg/kg。“因此，这一是安全的”。

       对于这些检测机构的独立，媒体质疑称，“国家食药监局……以‘中央财政补助资金’的选择性投放来强化对检测机构的控制力；通过聘任检测机构的检测员为‘餐饮服务食品安全专家’、‘保健食品安全专家委员’等手段与检测机构的核心技术人员直接建立联系。”

　　媒体报道认为，保健食品检测流程还只是管中窥豹，事实上，保健食品从建章立制、行政许可、审评审批到市场监测、检验机构、行政处罚等所有环节，权力都集中在一个部门即国家食药监局保健食品与化妆品监管司的手中。